公元258年，在地處中原東南的吳國再次建立29年后，剛剛從瑯琊王之位在政變中登基為吳景帝的孫休，在成為吳國第三位皇帝之時，創(chuàng)立太學(xué)，設(shè)太學(xué)博士制度，詔立五經(jīng)博士，為南京太學(xué)之始，韋昭為首任博士祭酒。這一年被認(rèn)為是南京官辦學(xué)堂的最高學(xué)府創(chuàng)設(shè)之年

此后，除在戰(zhàn)亂及新舊兩朝更替時出現(xiàn)暫時中斷外，南京官辦學(xué)堂歷代延綿不絕。

317年，晉元帝司馬睿于建康(今南京)設(shè)太學(xué)，歷經(jīng)宋、齊、梁、陳四朝，建康太學(xué)綿延不斷。南朝宋時，建康太學(xué)分設(shè)文、史、儒、玄、陰陽五科學(xué)館，為世界上第一所分科制高等學(xué)府、教育與研究合一的大學(xué)。歷代設(shè)校于秦淮河畔夫子廟一帶、欽天山下等處

隋唐時間，南京太學(xué)被取消，僅余下地方性學(xué)校的低迷時期后，南唐在南京重新建立起太學(xué)，隨后順延至北宋江寧府學(xué)，南宋時期，建康成為行都，也設(shè)有國子監(jiān)，元朝改集慶路學(xué)。

明朝定都南京，在原六朝皇家園林華林園舊址及南朝太學(xué)原址欽天山下建立起國子監(jiān)。至1393年(明洪武二十六年)時，南京國子監(jiān)監(jiān)生達(dá)八千一百二十四人，為當(dāng)時世界上規(guī)模最宏大的學(xué)府。到永樂年間，學(xué)生超過萬人，東亞南亞諸國均派留學(xué)生來南京國子監(jiān)學(xué)習(xí)，故譯學(xué)盛興。

那時在南京下關(guān)設(shè)有造船場，掀起了中世紀(jì)的航海事業(yè)。而在南京國子監(jiān)后面的欽天山上，建有明朝皇家天文臺——欽天監(jiān)觀象臺。這些都為南京國子監(jiān)學(xué)生開闊眼界提供極大便利。

清朝建立后，南京國子監(jiān)降格為江寧府學(xué)，仍然于明朝國子監(jiān)舊址辦學(xué)。

1902年，江寧府學(xué)改辦為三江師范學(xué)堂，后更名兩江師范學(xué)堂，民國建立后，改辦成為南京高等師范學(xué)校，成為當(dāng)時全國六大高師之首，旋即“高師改大”，易名國立東南大學(xué)，與國立北京大學(xué)一同成為當(dāng)年全國僅有的兩所國立大學(xué)。

之后名稱有 國立第四中山大學(xué)(1927-1928)

國立江蘇大學(xué)(1928-1928)

國立中央大學(xué)(1928-1949)

1949年8月8日，接南京軍管會的通知，國立中央大學(xué)”正式更名為國立南京大學(xué)，翌年更名南京大學(xué)，

后經(jīng)院系調(diào)整為東南大學(xué)，南京大學(xué)等十二所高校，原址現(xiàn)為東南大學(xué)。

知名校友顧毓琇，吳健雄

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